高市早苗将面临管理困难并增加政治不确定性。高市早苗即将成为日本首位女首相，但她的政府在组建之初可能面临危机。自民党和公明党的执政联盟已经维持了26年。如果失去了明党的支持，他所在的自民党就会在国会失利，而高市则需要寻找新的政治盟友。然而，分析人士警告说，由于其对移民政策和战争历史理解的强烈视角，很难找到合适的合作伙伴。此外，日本还面临总统关税政策带来的经济压力。天普大学日本大学校园的亚洲研究教授库切克表示，高端市场面临很大的不确定性，几乎没有什么好的选择。一种可能性是自民党继续推无望，等待后高行情时期的到来。有人认为，高市的领导生涯可能进入倒计时，让人想起日本政坛令人不安的过去：“首相门”期间回归。报道指出，高市当选自民党总裁数小时后，公明党党魁齐藤哲夫和党内高级官员会见了他，并对高市可能参拜靖国神社的阵营及其对在日外国人的公众形象表示担忧。斋藤哲夫警告称，除非马利诺在这两个问题上获得保证，否则公明党不会留在执政联盟。大阪府知事桥本彻虽然支持修宪以及对华采取强硬立场，但强烈反对高一参拜靖国神社，并希望未来的首相明确不要重蹈太平洋战争的覆辙。对于高一来说，他的政治生涯是建立在意识形态信仰之上的保证是不可能的。如果没有新的盟友，他的政府可能会在宣誓之前以政治僵局告终。高市在竞选自民党总裁期间，提出了与保守日本维新党合作的想法。但库切克看到了这种合作的危险，因为历史经验表明，小政党与自由民主党互动会对后世造成影响，导致在下次选举中表现不佳。双方在范围层面上也存在直接竞争。日本维新会在失去了公明党的动员能力后，很容易就能将足够的选民吸引到单一选区，造成自民党的失利。